建立高精確度RNA剪接預測變異模型 加速精準醫療與科研開發-科學人雜誌
有庠科技獎

建立高精確度RNA剪接預測變異模型
加速精準醫療與科研開發

2023/08/21 有庠科技獎企劃製作
有庠科技論文獎 - 生技醫藥

林倩伶
Chien-Ling Lin

中央研究院分子生物研究所助研究員

得獎論文:
人類疾病相關內含子突變干擾RNA剪接的機制與預測( Mechanism and modeling of human disease-associated near-exon intronic variants that perturb RNA splicing )

基因體定序技術近年來飛速發展,儘管能有效判定人體基因序列單點胺基酸突變,然而用以偵測核醣核酸(RNA) 剪接錯誤的工具,卻相對較少。而建立一個高精確度的預測剪接變異模型,意味能夠在基因診斷、精準醫療上,提供更細緻與客製化的預測。

林倩伶的研究團隊著重於基因片段中內含子的突變研究。此獲獎研究,預先檢驗11,191個突變位點,再以統計方式建模,結合臺灣人體資料庫,設計出能夠解釋剪接變異機制,且更加精準預測剪接變異的模型「SpliceAPP」。研究發現,高強度的剪接點與外顯子可對抗在內含子發生的突變,且藉由模型的參數,更細化內含子3’及5’端點因不同機制所產生突變的模型。

此跨領域研究的一大突破點為模型的建立。為了釐清各項預測結果的參數和調控機制,研究團隊不使用AI,而採用數學統計方式建立模型,研究結果顯示此模型不但能有效地解釋剪接機制,更是全球預測精準度最高的模型。目前,該模型開放網頁版本(https://bc.imb.sinica.edu.tw/SpliceAPP/),供醫療人員或相關研究者使用。此外,中央研究院智財技轉處亦協助此研究成果的專利權部署。

林倩伶表示,此次獲獎相當感謝中央研究院統計科學研究所的黃彥棕研究員、參與此研究的實驗室同仁、學生,以及家人的幫助。期望這項成果未來可提供醫療方面所需的技術分析,提高精準醫療速度與準確度。


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