科學人雜誌
科學人剪影

站在生物學邊上的物理學家

2008/05/02 班尼歐斯(Thania Benios)
魏金斯希望能用機器學習來發展模式,以預測在各種狀況下生物體內所有基因的表現,進而解釋某些細胞異常或轉為癌細胞的原因。

重點提要

魏金斯希望能用機器學習來發展模式,以預測在各種狀況下生物體內所有基因的表現,進而解釋某些細胞異常或轉為癌細胞的原因。
魏金斯坐在機場的接駁巴士裡,準備前往卡維里理論物理研究所演講。此時他收到一位同事的訊息,而打開了一個微軟Excel檔案。表格內的數字和他受邀主講的生物高分子物理學(biopolymer physics)沒什麼關係,反而跟出芽酵母菌(budding yeast)的基因活動有關,更清楚的說,這些數字是酵母菌在生殖週期當中,全部6200個基因所表現的信使RNA(mRNA)量。魏金斯回憶起2002年春天的那個日子,他說:「那是我生平第一次看到這樣的東西。」當時他同事問的是:「你怎麼解釋這些數據?」這位美國哥倫比亞大學的應用數學暨物理學家當年36歲,決定認真思考這個問題,而沒有逃避它,經過六年的光陰,他想他現在有了答案。魏金斯深入他所不熟悉的領域,費心使用人工智慧中的機器學習工具,將真實世界中生物基因製造蛋白質的相關資訊模組化。1950年代後期,工程師為了預測輸入電腦的資料會產生什麼結果,而設計了這些工具,現在,魏金斯他們把機器學習引進自然科學領域,但並非讓它預測輸入與輸出,而是分析介於其間的「基因調控模式」這個黑盒子裡,裝著什麼秘密。這項工作的推動始於1990年代後期,因為高產量技術的出現,可...

登入會員以閱讀更多精彩內容

# 關鍵字:名家專欄物理科學人剪影
更多文章
活動推薦更多
追蹤科學人